在MS開發過程中的最大技術障礙，除了前述之能源與動力系統之外，便是如何將MS的複雜機體控制，盡可能直接化的
操控系統(control system)問題。
在MS薩克被研發出來的時點，
人形機體之自主控制技術已告成熟確立。當然在理論上，以雙腳站立步行對應地形的隨機變化，或從喪失平衡狀態的回復等等，並不需要藉由駕駛員的手動操控來達成。
但事實上，因為各種狀況過於複雜且分歧的結果，要達成上述自動化操控的目標是不可能的。
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MS開發測試中的紀錄影像
此張攝於0070年左右的紀錄片影像,地點應在吉翁某秘密軍事實驗場,且可由機體判斷為薩克之先期研發機.
而由突發之機體傾覆事件可知,即便人型機械的自動平衡操控已有進步,但仍有所不足之處.... |
要提到困難，莫過於要讓駕駛員的各種意志反應在機體動作上之操控問題。
要作到使MS單純動作的程度並不困難。不管怎樣，透過自動控制設計，基本的動作幾乎無須駕駛員操作便可進行。
但在實際戰鬥中運用MS的狀況，便不是如此單純。 事實上，如果將MS置換成人類步兵來考量的話，在人類要產生何種動作時，並不會逐一注意手腳四肢各部位的動作。
舉例而言，在進行槍砲射擊的場合，人類以靈活的手部握著槍柄，舉起持槍的手腕與臂部，以準星瞄準目標並扣下板機，這一連串的動作，人類可在幾乎無意識中自動進行。
然而，在如同前述單純組合下，MS的操控體系只可進行單純的射擊，而駕駛員的立即處理能力應該也已經被制約。
況且，在實際的作戰行動中，則要持續進行遠較繁複的各種動作。 在此方面，
MS薩克的操控系統方案，則以
機體行動目的來區別，使一連序的動作
程式化(當然，在各種動作中將因應狀況變化，而進行自動控制。)，而駕駛員便從這些程式中，選擇合乎其所欲之行動目的者。此系統被稱為
「主動任務控制」(active mission control,簡稱AMC)。
就此種稍嫌單純的操控系統，在當初亦有許多質疑AMC效用的論調，但搭載AMC的實驗機與其他競爭系統時，則具有壓倒的優勢結果。因此,AMC便正式地被採用為薩克的操控系統。 AMC雖是單純的系統，但拜其簡易單純之故，使其能夠非常彈性的運用。
而駕駛員的養成也變得較為容易，其結果，也是使吉翁軍在短期內產生眾多熟練駕駛員的主因。
[學習型電腦之出現]
經過反覆的實際作戰行動經驗，數項關於AMC的缺陷點被提出探討。
在此之中最重大的問題，便是針對想定以外的意外狀況，ACM無法加以有效的因應。
特別在薩克開始運用之後，程式範圍外的突發事項接連發生。雖然在AMC的設計上，對於例外事項所造成的危險，也可
組合搭配各行動選擇而加以避免，
但在實際的運作上，除了一部份天才外，如此成功地作到緊急迴避性操控的駕駛者，則是很稀少的。 此問題雖被認為可由收集
MS行動資料而解決，但
資料量的膨脹，也造成駕駛員負擔的增加，結果使MS表面上的性能，變得更大幅依存於駕駛員自身技術的情形。
嗣後，AMC歷經多次的改良工作，達到新手士兵也可發揮最低限度機體性能的程度，但薩克的戰鬥能力，也比當初所預定的水準要被降低得許多。 關於MS開發，遠較吉翁落後的聯邦軍，從研發當初便致力於開發出超越AMC的操控系統。
此後的完成品，即一般稱為
「學習型電腦系統」，正式名稱為
「智慧型導航控制」(簡稱ICN)的操控系統，並約從稱為
鋼彈的試作MS開發計劃的最後階段導入。 此ICN系統基本上雖並未改變AMC系統，但後者的重大缺點，即伴隨資料量增大而使操作性下降的問題，則完全獲得解決。
此為
弗拉那甘博士(當時歸屬吉翁公國，在被稱為新人類的特殊能力者研究上，留下許多成績的人物)，於大戰前所發表之
「先制性行動預測理論」應用於電腦系統的成果。
「先制性行動預測理論」為將
新人類能力者「事先判讀狀況能力」的理論化產物。在ICN系統，基於此理論所開發的電腦，將嘗試事先判斷駕駛員思考的驚人之舉。 實際上ICN所能預測的，仍是在相當短的時間範圍內，且僅侷限在有某種程度預測幅度之情形，
即使如此，此系統確實為MS的操控系統帶來重大進步。引入ICN的操控電腦，能配合駕駛員之思考模式或心理狀態，以適切的形式提供其操作方法 (令人驚訝的是，在完全與駕駛員同步的系統上，操作失誤的可能性幾乎可以減到最小)，使即使是初次駕馭MS的人,也可發揮與一般士兵駕駛的薩克抗衡程度之充足性能。 此實際例證，可在試作
MS鋼彈的初次實戰中，由幾乎未經駕駛員訓練的
阿姆羅˙雷所創下的戰果而得。日後觀察阿姆羅˙雷的能力，其成果也是令人驚異的，
而此結果也使吉翁方面對ICN的效用留下深刻的印象。
[學習型電腦與其應用]
ICN系統基本上沿用了既有電腦系統。如同前述，其構造與歷來之AMC系統幾乎未有改變，而「事先判讀」系統，則透過
內建之軟體部分加以實現。
在電腦技術約已達到上限的現狀下，如同人類般思考的電腦系統仍未成功開發問世。
此種系統因為要徹底模擬人類的思考模式，為了系統運作機能，大量的
事例學習(case study)是必須的。
而這也是ICN被冠上
「學習型電腦系統」此別名的緣故。 特別是初期鋼彈的運作資料，將對日後
量產機GM之ICN產生重大的貢獻。
以性能而言，除引擎出力外約略與薩克同等級的GM，卻也留下預想之上的戰果，以鋼彈歷練出來的ICN系統應被大加考慮。 此外，到了大戰後期，吉翁方面也終於開始導入與ICN相當之
AAMC(advanced active mission control)系統。最初採用AAMC之機體，為
陸戰MS德姆(MS-09)，一部份
水陸兩用MS也加以採用。
此類機體由MS之
王牌飛行員(ace)所供給，相關單位並傾全力收集進度遠較聯邦INC系統落後的駕駛員資料。 然而直到戰爭結束，AAMC並未完全普及化。這可說是由於深植於吉翁軍內部的派閥意識之結果。
由於吉翁軍有如此多樣化的MS存在，使開發體系也無法加以一元化，此對AAMC的導入造成極大的障礙。
談到在吉翁軍內部感興趣的MS操控系統，應該莫過於對被稱為
「賽可謬」(psycomu, psychological communication之簡稱)之思考控制系統。
此系統除了由弗拉那甘博士的研究組織所研發，透過
介面(interface)直接運用駕駛員的腦波外，其他部分則非常酷似於ICN系統。 賽可謬系統能直接模擬具新人類能力駕駛員的思考。為此之故，其遠較
擬真思考預測之ICN系統，獲得更長時間的同步效果(據說最久可達數分鐘)，使其在米氏粒子下得以實現
遠距離操作功能。
雖然此技術後來被應用於
無人機bit上，並在戰鬥中以單機獲得絕大的戰果，但因駕駛員需要非常特殊的才能，也需配合特定駕駛員研發完整之
特製機種，一般而言，仍非實用普及化的系統。 另一方面，因阿姆羅˙雷出現而不得不承認新人類存在的聯邦軍，也繼續開發比ICN更為擴充之新人類型式之
NICN系統。
此雖亦搭載於鋼彈試作3號機以後之機體，但在未獲得充足資料收集前便遭到擊毀。
(老戰友註：此處所指的應是NT-1用機)。
傾向重視兵器泛用性的聯邦軍系開發陣營，在此之後中止其對新人類相應兵器的開發計劃，傾注力量於完成充當一般兵器之MS。
但在其他開發機關中，賽可謬研究仍被繼續進行，並將在往後的時代佔有極為重要的地位。
